После османского завоевания Афин султан решил позволить городу быть многоэтническим, издав указ о защите и перепрофилировании большинства храмов и памятников для общественного пользования. Этот указ действовал во время оккупации режима.
В 1759 году османский губернатор Афин Мустафа Ага Цистаракис приказал построить мечеть на площади Монастираки. В нарушение указа султана Цистаракис разрушил одну из колонн древнегреческого храма (то ли Храма Зевса Олимпийского, то ли Библиотеки Адриана), чтобы сделать известь для здания.
Местное суеверие того времени заключалось в том, что разрушение храмов влечет за собой эпидемии. Поэтому, как только местные жители обнаружили, что мечеть сделана из фрагмента разрушенного храма, они пришли в такую ярость, что султан изгнал Цистаракиса из Афин, чтобы умилостивить их. Этого изгнания, по-видимому, было недостаточно, так как позже Цистаракис был убит.
Квадратное двухэтажное здание было увенчано полусферическим куполом, сидящим на восьмиугольном основании, покрытом керамической черепицей. Первоначально интерьер был от пола до купола, но теперь он двухуровневый. С западной стороны здания находится открытый портик с тремя арками с тремя небольшими куполами. Над дверью основатель разместил надпись, которая видна до сих пор.
Здание служило мечетью до начала греческой войны за независимость, когда оно использовалось как зал собраний для старейшин. После обретения независимости от османов греческое правительство реквизировало здание и на протяжении многих лет использовало его по-разному, в том числе в качестве тюрьмы, казармы, склада и места проведения военных концертов и мероприятий. Где-то между 1839 и 1843 годами минарет здания был разрушен.
В 1915 году здание было отремонтировано и в 1918 году открылось как первый Музей греческих ремесел. Небольшая пристройка на первом этаже была добавлена в 1920 году, а в 1923 году она была переименована в Музей декоративного искусства. В 1966 году здание было временно отремонтировано, чтобы предоставить место молитвы королю Саудовской Аравии Сауду во время его визита в Афины. В 1975 году он был преобразован в пристройку Музея греческого народного искусства и действует до сих пор. В 1981 году здание пострадало от землетрясения и было вновь открыто для публики в 1991 году. Во время восстановительных работ после землетрясения были созданы дополнительные музейные выставочные площади.