27 мая 1942 года заместитель рейхспротектора Рейнхард Гейдрих, известный как «Пражский мясник» и правая рука нацистского лидера Генриха Гиммлера, подвергся нападению чешских парашютистов, прошедших подготовку в Великобритании, в ходе операции «Антропоид». через неделю скончался от полученных травм. Это было одно из немногих успешных убийств высокопоставленного нацистского чиновника, и последствия были быстрыми и жестокими.
После нападения 13 000 человек были заключены в тюрьму и допрошены. Ошибочно полагая, что преступники были связаны с деревней Лидице, нацисты убили более 5000 человек, а также сожгли и сравняли с землей весь город, даже после того, как поняли, что связь была ложной. Они даже разрушили деревенское кладбище, выкопали мертвых и изменили русло реки, чтобы от Лидице «ничего не осталось».
После убийства чешские десантники три недели прятались в склепе церкви, пока их укрытие не было выдано. Около 750 немецких солдат окружили церковь, пытаясь удушить их газом, а затем затопили склеп пожарными шлангами через крошечную щель в стене. В бою погибли трое десантников; остальные четверо покончили с собой, но не сдались. Священник и епископ, приютившие солдат, позже были убиты нацистами. В 1945 году чешский предатель, выдавший их тайник, был арестован за измену и казнен.
В самом склепе, ныне маленьком музее, получившем название Национальный мемориал героям Гейдриховского террора, на стенах до сих пор можно увидеть пулевые отверстия и шрапнельные шрамы. Есть также следы последних отчаянных попыток десантников прорыть туннель для побега в канализацию. Снаружи узкая щель в стене склепа, куда немцы вставили свои пожарные рукава, до сих пор покрыта следами от пуль. Сообщается, что последними словами десантников были: «Мы не сдадимся. Никогда. Мы чехи».