В 4 веке н.э. король Ниневии Сенхареб заказал строительство этого монастыря в качестве искупления за то, что он убил своего сына Бехнама и дочь Сару за обращение в христианство.
Бехнам, в конце концов, был освящен, отсюда и титул Мар, титул святости на ассирийском языке. Тела его и Сары были похоронены в склепе в монастыре. Это место быстро стало маяком для христианских паломников по всему региону.
В результате монастырь привлек несколько художников, которые пополнили коллекцию артефактов картинами, барельефами и статуями. Чем престижнее становился монастырь, тем больше паломников он привлекал. Это также вызвало гнев других групп по всему региону.
В частности, Надир-шах нацелился на монастырь в 18 веке из-за его важности для христианства. Несмотря на повреждения, монастырь устоял. В течение следующих нескольких лет было проведено несколько реставраций в попытке сохранить бесценные произведения искусства и архитектуры монастыря.
Исторические связи сайта совсем недавно привлекли внимание террористических организаций, таких как Исламское государство. В 2015 году группа заложила вокруг монастыря 19 бомб, пытаясь его разрушить. Однако они не взорвались, за исключением нескольких бомб, заложенных поблизости, которые действительно повредили монастырь.
К сожалению, гробницы Бехнама и Сарры были разрушены, но монастырь уцелел. В настоящее время ведется обширная работа по спасению того, что можно спасти, ремонту того, что можно восстановить, и восстановлению того, что было разрушено.