Миссия Сан-Хосе была основана в 1720 году Фраем Антонио Маргил де Хесус, и в то время в ней проживало более 300 жителей. Она быстро стала крупнейшей техасской миссией, и ее часто называли «Королевой миссий». (Испанские миссии были не церквями, а целыми общинами, ядром которых была церковь.)
Миссия Жители Сан-Хосе работали и жили там и завершили комплекс в 1782 году. Хотя миссия прекратила свою деятельность в 1824 году, она крестила более 2000 индейцев.
Сегодня Миссия Сан-Хосе по-прежнему является активным приходом и по воскресеньям проводит открытые мессы. Он поддерживается Службой национальных парков и настолько хорошо сохранился, что позволяет посетителям увидеть, как могли выглядеть миссии более 250 лет назад.
Хотя церковь не была единственной функцией миссии, она была ее центром, и среди наиболее примечательных особенностей построек на месте - резьба по дереву и знаменитое «Окно-роза», считающееся одним из лучших произведений искусства. испанского колониального орнамента в стране.
Другие примечательные особенности района Миссии включают лестницу на церковную колокольню и хоры: каждая из двадцати пяти ступеней была вырезана вручную из цельного бревна живого дуба и построена без гвоздей и колышков. На территории также есть зернохранилище, поддерживаемое контрфорсами, мельница, отреставрированные оборонительные стены и жилые помещения.
В 1941 году Миссия Сан-Хосе была объявлена Государственным историческим памятником, а также Национальным историческим памятником. Восстановленная мельница - старейшая мельница в штате Техас.